Hygiène publique et protection de l'environnement : tels sont les deux objectifs du service assainissement. Consistant à collecter, transférer et traiter les eaux usées domestiques, cette mission est devenue une compétence de la Métropole au 1er janvier 2001.
A ce titre, Nantes Métropole détermine les modes de gestion et fixe les tarifs de l'assainissement sur l'ensemble du territoire métropolitain.